基序，亦称模序、模体。是指DNA、蛋白质等生物大分子中的保守序列，介于二级和三级结构之间的另一种结构层次。所谓结构域指蛋白质亚基结构中明显分开的紧密球状结构区域，亦称辖区。多肽链首先是在某些区域相邻的氨基酸残基形成有规则的二级结构，然后，又由相邻的二级结构片段集装在一起形成超二级结构，在此基础上多肽链折叠成近似于球状的三级结构。对于较大的蛋白质分子或亚基，多肽链往往由两个或多个在空间上可明显区分的、相对独立的区域性结构缔合而成三级结构，这种相对独立的区域性结构就称为结构域。对于较小的蛋白质分子或亚基，结构域和它的三级结构往往是一个含义，也就是这些蛋白质或亚基是单结构域。结构域自身是紧密装配的，但结构域与结构域之间关系松懈。